世界管理系统——分形系统(Fractal System)使人类摆脱了工作的烦恼，踏入乐园世纪。 千年之后的未来，已经没有人能够解析这个系统。然而大多数的人相信，只要分形系统持续运作，就能维持人类恒久不变的幸福。 而故事就从分形系统开始崩坏开始… 在一个远离大陆的小岛上，每天散漫渡日的少年Clain，某日救了不知被什么东西追赶而掉下悬崖的少女Phryne。就在Clain为了与少女的相遇而雀跃之时，Phryne却只留下了胸针后消失。依照著胸针里留下的资料，Clain与少女型导航员Nessa一起踏上旅途，慢慢接近系统不为人知的秘密…。